Les Cartons du Coeur ont été créés en 1992 à Neuchâtel par le journaliste Laurent Borel qui était l’entraîneur d’une équipe de jeunes footballeurs. Un jour il avait découvert que certains de ses protégés ne mangeaient pas à leur faim. Après avoir récolté des fonds en nettoyant les rives du lac de Neuchâtel avec son équipe, il achète de la nourriture qu’il fait parvenir aux familles des jeunes. Ainsi sont nés les Cartons du Cœur.
 
Aujourd'hui l'association compte dans le canton de Vaud 16 antennes qui sont chapeautées par la Fédération Vaudoise des Cartons du Cœur.